親から相続した畑に将来家を建てたいのでとりあえず更地にすることはできますか？

農地転用の難しいところは「とりあえず」は通用しないことです。

転用許可後は速やかに転用計画に沿った工事を実施しなければなりません。

主な理由は、投機目的の農地の売買を禁止するためです。

家を建てる場合は、転用許可後に速やかに家を建てる必要があります。

よって、家を建てないで更地にしておくことはできません。