農地転用許可申請と町づくり条例

農地転用許可申請は農地法（法律）に基づく申請ですので全国共通のルールです。
それに対して町づくり条例は市町村が独自に制定した法令（条例）ですので市町村によってルールが異なります。
町づくり条例の手続きは土木工事専門の設計事務所と共同で手続きを進める必要があります。